Total Commander

[Skif_off]

Всё-таки система может быть достаточно производительная, наверное, можно попробовать отслеживать количество процессов кодировщика (SELECT * FROM Win32_Process WHERE Name = ..., потом Count): если, например, больше 4, то для очередного запуска WaitOnReturn равно true и наоборот.
Оно, конечно, не всегда будет красиво работать, но всё одно не по очереди и не всей кучей сразу.